lncrna芯片
long non-coding rnaslncrnas是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200 nt的功能性非編碼rna分子,。目前的研究已證實,lncrna參與x染色體沉默,,基因組印記以及染色質(zhì)修飾,,轉(zhuǎn)錄ji活,,咸陽pcr,轉(zhuǎn)錄干擾,,-,,核內(nèi)運輸?shù)榷喾N重要調(diào)控過程。隨著對lncrna在哺乳動物進化及人類---發(fā)生和發(fā)展中作用的日益關(guān)注,,lncrna調(diào)控機制已成為當(dāng)前遺傳學(xué)研究的---問題,。
篩選出差異表達的lncrna是研究其在人類---發(fā)生中所扮演角色的基礎(chǔ)。富衡生物為用戶提供高通量的lncrna芯片進行l(wèi)ncrna表達譜分析,,該芯片基于agilent的sureprint技術(shù)生產(chǎn),,實驗,。
技術(shù)優(yōu)勢
信息覆蓋廣泛:覆蓋了多個quan威lncrna數(shù)據(jù)庫發(fā)布的數(shù)據(jù);提供人,,小鼠,,大鼠的lncrna檢測。
lncrna和mrna同時檢測:芯片上包含有的lncrna和新的mrna序列檢測探針,。一次芯片實驗可同時對lncrna和mrna進行分析。
平臺成熟---:采用agilent原位噴墨合成技術(shù),,了高檢測靈敏度和特---,。
數(shù)據(jù)分析:提供lncrna和mrna表達譜差異分析和功能分析,以及二者的關(guān)聯(lián)分析,。
str檢測
短串聯(lián)重復(fù)(short tandem repeats,, str),又稱微wei星dna(microsatellite dna)或簡單重復(fù)序列(--- repeat sequence,,---怎么做,, srs或ssr),是廣泛存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列,。有絲分裂過程中dna鏈之間的錯配引起的fu制滑動被認為是導(dǎo)致str產(chǎn)生的較為常見原因,,并且依據(jù)不同fu制單元大小的不同以及不同物種之間,fu制滑動發(fā)生的概率也不相同,。
str是以序列 (core repeat units) 首尾相連多次重復(fù)形成,。每個str的序列結(jié)構(gòu)相同,長度為2-6bp,,但其重復(fù)單位數(shù)目和重復(fù)區(qū)域的長度不同,,因此str在不同種族、不同人群之間的分布具有差---,,構(gòu)成了str遺傳多態(tài)性,。不同個體之間在一個同源str位點的重復(fù)次數(shù)也不同,因而同指紋識別一樣,,str位點分析也可對個體進行身份識別,。通過識別個體基因組在特定位點的特定序列重復(fù),即可創(chuàng)建其基因檔案,�,;诖耍瑂tr分析法已經(jīng)成為一種重要的鑒定分析方法,,應(yīng)用于---學(xué),、qin子鑒定及細胞鑒定等領(lǐng)域。
20.primer設(shè)計的基本原則是什么,?
答:引物設(shè)計的下列原則供您參考,。
◆引物長度一般在18-35mer,。
◆g-c含量控制在40-60%左右。
◆避免近3端有酶切位點或發(fā)夾結(jié)構(gòu),。
◆如果可能避免在3端5個堿基有2個以上的g或c,。
◆如果可能避免在3端1個堿基為a。
◆避免連續(xù)相同堿基的出現(xiàn),,---是要避免gggg或更多g出現(xiàn),。
◆退火溫度tm控制在 58-60c 左右。
◆如果是設(shè)計點突變引物,,突變點應(yīng)盡可能在引物的中間,。
21.為什么引物的od260/od280小于1.5 ?
答:引物應(yīng)該全是dna,,實時熒光定量pcr,,但是od260/od280的比值為什么那么低,怎么會有蛋白質(zhì)污染,?引物化學(xué)合成,,哪里有機會污染到蛋白質(zhì)?需要-的是od260/od280的比值不能用來衡量引物的純度,。od260/od280的比值過低一般是由于引物中c/t 的含量比較高所致,。下表是一個20mer 同聚體引物的od260/od280的比值,清楚表明od260/od280的比值與引物的堿基組成密切相關(guān),。
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